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AI分子对接的方法快速筛选2019-nCov新型冠状病毒的潜在有效药物
    一、筛选目的
    通过AI分子对接的方法快速筛选2019-nCov新型冠状病毒的潜在有效药物。
   
    二、筛选材料及方法
    1、晶体文件的获得:2019-nCoV Mpro蛋白(3CL)的晶体结构由中科院饶子和院士团队提供
    2、药物数据库(Ligand):ZINC数据库(6000个天然化合物、4000多个中药化合物)
    3、采用Vina软件筛选配体与受体的结合
    4、筛选得到亲和力大于-10 kcal/mol的化合物作为候选,并在DrugBank数据库里寻找类似物,进行二次筛选并评估。
   
    三、筛选结果
   
    1、ZINC: ZINC85568688、ZINC85542646、ZINC95919448
    2、DrugBank: Rifabutin、Rifapentine、Rifamycin、Trabectedin、Rifampicin

 图1 Rifatubin与Mpro对接的结果(affinity为-16.1kcal/mol)

表1 AI筛选潜在有效的药物
 
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